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经典案例
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自闭症全基因测序鉴定新的突变
研究背景
新的突变在自闭症基因图谱紊乱中是很重要的，但是目前的分析仅局限在1.5%左右的编码基因上。本研究，我们对200个自闭症的父母孩子进行了全基因的测序，并鉴定了生殖突变和体细胞突变。
研究方法
研究结果
1 新突变序列分析。a：不同类型的突变转换与颠换的比例；b：不同的新突变的碱基替换情况。
2 自闭症新突变的来源。a：父母双方来源的生殖突变和体细胞突变；b：父母来源突变会随着父亲年龄的增加而增加，而母亲没有显著影响；c：个体内与个体间突变的距离；d：拷贝数突变。
3 基因组范围内新突变的影响。a：有危害的新突变富集在编码区与非编码区域都；b：非编码区域的新突变在DNase I激活区域显著富集。c：GO富集。
研究结论
我们发现大部分新的突变来源于父亲，随着年龄的增加而增加。而，附近的新突变，多来源于母亲，常伴随着新的拷贝数的变异。相较于对照，发现一个显著的富集，大约15.6%和22.5是非编码的和遗传非编码的。非编码的突变多富集的基因非编码区域，外显子跳跃的调控区域和DNaseI敏感区域。使用芯片或其他的检测方式，我们也发现2/185自闭症人群中存在异常的甲基化。我们的数据展示了不同的基因组范围上的新突变，并提高了对自闭症人编码基因突变的认识。
参考文献
Genome-wide characteristics of de novo mutations in autism. [Npj Genomic Medicine, 2016]
