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 数据分析

◆ 基因定量分析基因表达定量,基因差异表达分析

◆ 功能富集分析差异表达基因GO/KEGG富集分析,GSEA富集分析,其他通路/功能信息挖掘;

◆ 网络构建筛选hub基因差异表达基因蛋白网络,基因共表达网络分析

◆ 基因可变剪切分析:可变剪切转录本鉴定,可变剪切转录本差异筛选

◆ 突变位点分析基因CDS区突变位点SNPINDEL鉴定,及位点影响注释;

◆ 融合基因:多算法鉴定,筛选疾病相关融合蛋白;

 

 

 

 

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Hiseq 150PE测序     12G数据量     标准分析+个性化分析

 

 

 

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 除标准分析外,支持免费个性化分析,比如数据图表重新绘制,特殊数据挖掘,分析

 

数据分析

 基因整体分析:基因定量,差异表达基因GO/KEGG富集分析,GSEA富集分析,基因蛋白网络,基因共表达网络分析;

mRNA分析mRNA转录本鉴定,定量及差异表达分析,功能富集分析预测;

lncRNA分析lncRNA转录本鉴定,定量及差异表达分析,lncRNA cis/trans靶基因预测,lncRNAmRNA共表达分析鉴定lncRNA靶标mRNA

circRNA分析circRNA多算法鉴定,定量及差异表达分析,circRNA miRNA ceRNA网络构建,circRNA靶基因预测及其功能富集分析;

◆ 基因可变剪切分析:可变剪切转录本鉴定,可变剪切转录本差异筛选

◆ 突变位点分析基因CDS区突变位点SNPINDEL鉴定,及位点影响注释;

◆ 融合基因:多算法鉴定,筛选疾病相关融合蛋白;



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上海生命基因以解读生命基因、探索生命奥秘为宗旨专业提供二代、三代高通量测序技术服务,包括:转录调控测序:mRNA测序、lncRNA测序、circRNA测序、miRNA测序、全转录组测序、全长转录组测序;基因组测序:人基因组测序、外显子组测序、动植物基因组de novo测序、遗传图谱构建;微生物测序:宏基因组测序、宏转录组测序、微生物多样性分析、真菌/细菌de novo测序。

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